Protein–RNA interactions for Protein: P43268

ETV4, ETS translocation variant 4, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ETV4P43268 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
ETV4P43268 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
ETV4P43268 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ETV4P43268 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
ETV4P43268 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
ETV4P43268 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
ETV4P43268 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETV4P43268 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETV4P43268 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETV4P43268 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETV4P43268 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
ETV4P43268 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
ETV4P43268 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
ETV4P43268 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV4P43268 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV4P43268 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV4P43268 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV4P43268 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV4P43268 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV4P43268 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
ETV4P43268 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ETV4P43268 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
ETV4P43268 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ETV4P43268 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
ETV4P43268 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ETV4P43268 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
ETV4P43268 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
ETV4P43268 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
ETV4P43268 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETV4P43268 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETV4P43268 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETV4P43268 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
ETV4P43268 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
ETV4P43268 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETV4P43268 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETV4P43268 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETV4P43268 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETV4P43268 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETV4P43268 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETV4P43268 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETV4P43268 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
ETV4P43268 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETV4P43268 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETV4P43268 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETV4P43268 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETV4P43268 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
ETV4P43268 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV4P43268 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV4P43268 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV4P43268 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV4P43268 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV4P43268 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV4P43268 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
ETV4P43268 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETV4P43268 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETV4P43268 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETV4P43268 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETV4P43268 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETV4P43268 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETV4P43268 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
ETV4P43268 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms