Protein–RNA interactions for Protein: P43116

PTGER2, Prostaglandin E2 receptor EP2 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER2P43116 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGER2P43116 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGER2P43116 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGER2P43116 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC30.52■■■□□ 2.48
PTGER2P43116 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.48
PTGER2P43116 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC30.51■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.5■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.47■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC30.47■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC30.45■■■□□ 2.47
PTGER2P43116 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC30.42■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC30.41■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC30.39■■■□□ 2.46
PTGER2P43116 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.35■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC30.34■■■□□ 2.45
PTGER2P43116 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms