Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GRIA1P42261 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
GRIA1P42261 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GRIA1P42261 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms