Protein–RNA interactions for Protein: P40486

SHQ1, Protein SHQ1, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 507 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SHQ1P40486 NME1NME1 340 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 YPR160C-AYPR160C-A 285 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 NHP6BYBR089C-A 300 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 RAD24YER173W 1980 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 CLB1YGR108W 1416 nt6.42□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 PDR18YNR070W 4002 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 SLX5YDL013W 1860 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 SSK22YCR073C 3996 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 UTP4YDR324C 2331 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 MTC5YDR128W 3447 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 DOT5YIL010W 648 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 ATP4YPL078C 735 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 MET8YBR213W 825 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 HIR1YBL008W 2523 nt6.41□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 KEX2YNL238W 2445 nt6.4□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 ACS1YAL054C 2142 nt6.4□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 ERC1YHR032W 1746 nt6.4□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 IRC7YFR055W 1023 nt6.4□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 GCV3YAL044C 513 nt6.4□□□□□ -1.38
SHQ1P40486 PYC1YGL062W 3537 nt6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 GIT1YCR098C 1557 nt6.4□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 MPA43YNL249C 1629 nt6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YBR284WYBR284W 2394 nt6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 RME1YGR044C 903 nt6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 NMT1YLR195C 1368 nt6.39□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 HSP78YDR258C 2436 nt6.38□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 HAP2YGL237C 798 nt6.38□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 RPS5YJR123W 678 nt6.38□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YNL042W-BYNL042W-B 258 nt6.38□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 HAS1YMR290C 1518 nt6.38□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 GUA1YMR217W 1578 nt6.38□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 LAG2YOL025W 1983 nt6.37□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 SHO1YER118C 1104 nt6.37□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YER148W-AYER148W-A 579 nt6.37□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 FZF1YGL254W 900 nt6.37□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 EFT2YDR385W 2529 nt6.37□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 EFT1YOR133W 2529 nt6.37□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YPK2YMR104C 2034 nt6.37□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 CIT3YPR001W 1461 nt6.36□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 DIA3YDL024C 1407 nt6.36□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YDL129WYDL129W 876 nt6.36□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 RPS2YGL123W 765 nt6.36□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 DJP1YIR004W 1299 nt6.36□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 MKK1YOR231W 1527 nt6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YEH1YLL012W 1722 nt6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 NSE5YML023C 1671 nt6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 ATF1YOR377W 1578 nt6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 CYC8YBR112C 2901 nt6.35□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YDR109CYDR109C 2148 nt6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 CIN4YMR138W 576 nt6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YBL070CYBL070C 321 nt6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YBR226CYBR226C 411 nt6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 KTR5YNL029C 1569 nt6.34□□□□□ -1.39
SHQ1P40486 YFR006WYFR006W 1608 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 APE3YBR286W 1614 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 PTK2YJR059W 2457 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 YER186CYER186C 921 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 SUP19tS(UGA)E 82 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 SUP17tS(UGA)I 82 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 SUP16tS(UGA)P 82 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 ECM19YLR390W 339 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 SNN1YNL086W 309 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 AMA1YGR225W 1782 nt6.33□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 COX20YDR231C 618 nt6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 SEC20YDR498C 1152 nt6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 YOL131WYOL131W 327 nt6.32□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 GPA2YER020W 1350 nt6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 snR82snR82 268 nt6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 EGD2YHR193C 525 nt6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 STM1YLR150W 822 nt6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 RPN7YPR108W 1290 nt6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 ATG22YCL038C 1587 nt6.31□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 HXT15YDL245C 1704 nt6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 HXT16YJR158W 1704 nt6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 HXK2YGL253W 1461 nt6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 ATP1YBL099W 1638 nt6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 SCO2YBR024W 906 nt6.3□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 ERP5YHR110W 639 nt6.29□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 NPA3YJR072C 1158 nt6.29□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 YLR126CYLR126C 756 nt6.29□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 SHP1YBL058W 1272 nt6.29□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 POP1YNL221C 2628 nt6.29□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 PRI2YKL045W 1587 nt6.28□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 YML082WYML082W 1950 nt6.28□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 YDL057WYDL057W 987 nt6.28□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 YDL172CYDL172C 480 nt6.28□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 KSS1YGR040W 1107 nt6.28□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 LEU5YHR002W 1074 nt6.28□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 ASK1YKL052C 879 nt6.28□□□□□ -1.4
SHQ1P40486 ADE12YNL220W 1302 nt6.27□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 ATO3YDR384C 828 nt6.27□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 LYS12YIL094C 1116 nt6.27□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 YNL017CYNL017C 339 nt6.27□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 UBC11YOR339C 471 nt6.27□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 YBR056C-BYBR056C-B 159 nt6.27□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 QDR3YBR043C 2070 nt6.26□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 CHO1YER026C 831 nt6.26□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 PRS2YER099C 957 nt6.26□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 RBD2YPL246C 789 nt6.26□□□□□ -1.41
SHQ1P40486 MRPS5YBR251W 924 nt6.26□□□□□ -1.41
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