Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CHRNA7P36544 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CHRNA7P36544 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CHRNA7P36544 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms