Protein–RNA interactions for Protein: P32927

CSF2RB, Cytokine receptor common subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2RBP32927 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSF2RBP32927 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSF2RBP32927 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CSF2RBP32927 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms