Protein–RNA interactions for Protein: P32578

SIP1, SNF1 protein kinase subunit beta-1, yeast

Predictions only

Length 815 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SIP1	P32578	CDC34	YDR054C	888 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SIP1	P32578	UPS3	YDR185C	540 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SIP1	P32578	FBA1	YKL060C	1080 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SIP1	P32578	RPC19	YNL113W	429 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SIP1	P32578	YOL035C	YOL035C	303 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SIP1	P32578	GEX1	YCL073C	1848 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SIP1	P32578	UTP9	YHR196W	1728 nt		5.59	□□□□□ -1.51
SIP1	P32578	MED2	YDL005C	1296 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	PCL9	YDL179W	915 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YGP1	YNL160W	1065 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YBR027C	YBR027C	333 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	SCP1	YOR367W	603 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YPR130C	YPR130C	408 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	ARR1	YPR199C	885 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	FAT3	YKL187C	2253 nt		5.58	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YPQ2	YDR352W	954 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	ATG36	YJL185C	882 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	REX3	YLR107W	1215 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YLR358C	YLR358C	564 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	PPA2	YMR267W	933 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	EDE1	YBL047C	4146 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	GUP2	YPL189W	1830 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YHR020W	YHR020W	2067 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YFL042C	YFL042C	2025 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	CRF1	YDR223W	1404 nt		5.57	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	MST1	YKL194C	1389 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	STT3	YGL022W	2157 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	VPS61	YDR136C	573 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	HEM2	YGL040C	1029 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	GET4	YOR164C	939 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YPL014W	YPL014W	1146 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	CWC27	YPL064C	906 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YBR113W	YBR113W	483 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	STE13	YOR219C	2796 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	HSP104	YLL026W	2727 nt		5.56	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	PPM2	YOL141W	2088 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	MRPL1	YDR116C	858 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YML131W	YML131W	1098 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YOR268C	YOR268C	399 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	PET20	YPL159C	762 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	POS5	YPL188W	1245 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	HOS1	YPR068C	1413 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	GEX2	YKR106W	1848 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	CTF18	YMR078C	2226 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	GIT1	YCR098C	1557 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	THI2	YBR240C	1353 nt		5.55	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	MCM6	YGL201C	3054 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	ALD6	YPL061W	1503 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	LSM6	YDR378C	261 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	RPP1	YHR062C	882 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	DMA1	YHR115C	1251 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	COX17	YLL009C	210 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	UME1	YPL139C	1383 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	PRP46	YPL151C	1356 nt		5.54	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	EIS1	YMR031C	2532 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	PAF1	YBR279W	1338 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	XBP1	YIL101C	1944 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	FMP40	YPL222W	2067 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	MRPS28	YDR337W	861 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	SQT1	YIR012W	1296 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	KAE1	YKR038C	1161 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	MFA2	YNL145W	117 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	YNR005C	YNR005C	405 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	SMX3	YPR182W	261 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	GPA2	YER020W	1350 nt		5.53	□□□□□ -1.52
SIP1	P32578	PRY3	YJL078C	2646 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	NOP2	YNL061W	1857 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	FOB1	YDR110W	1701 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	HED1	YDR014W-A	489 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	CIA1	YDR267C	993 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YLL017W	YLL017W	312 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	PDB1	YBR221C	1101 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	DHH1	YDL160C	1521 nt		5.52	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	MSY1	YPL097W	1479 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	SKI8	YGL213C	1194 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	RHO4	YKR055W	876 nt		5.51	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	PRP24	YMR268C	1335 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	SCT1	YBL011W	2280 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YDL129W	YDL129W	876 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	TIM22	YDL217C	624 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	MCM21	YDR318W	1107 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YGL102C	YGL102C	429 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	PIH1	YHR034C	1035 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YJL171C	YJL171C	1191 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	MIA40	YKL195W	1212 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YLR123C	YLR123C	330 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	SEC62	YPL094C	825 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YBR124W	YBR124W	360 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	VHS1	YDR247W	1386 nt		5.5	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	MKK2	YPL140C	1521 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	KSH1	YNL024C-A	219 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YNL108C	YNL108C	813 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YNL120C	YNL120C	486 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	NOP13	YNL175C	1212 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	ERG10	YPL028W	1197 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	OAZ1	YPL052W	879 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	DAP1	YPL170W	459 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	YPL250W-A	YPL250W-A	288 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	TAH18	YPR048W	1872 nt		5.49	□□□□□ -1.53
SIP1	P32578	VPS70	YJR126C	2436 nt		5.48	□□□□□ -1.53

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 155.8 ms