Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATP5DP30049 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ATP5DP30049 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ATP5DP30049 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms