Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HLA-DMAP28067 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
HLA-DMAP28067 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms