Protein–RNA interactions for Protein: P27816

MAP4, Microtubule-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4P27816 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4P27816 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4P27816 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4P27816 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MAP4P27816 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4P27816 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4P27816 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4P27816 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4P27816 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4P27816 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4P27816 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MAP4P27816 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAP4P27816 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAP4P27816 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
MAP4P27816 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MAP4P27816 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MAP4P27816 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MAP4P27816 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MAP4P27816 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MAP4P27816 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP4P27816 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP4P27816 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP4P27816 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP4P27816 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MAP4P27816 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP4P27816 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP4P27816 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP4P27816 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP4P27816 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MAP4P27816 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP4P27816 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP4P27816 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP4P27816 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP4P27816 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MAP4P27816 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP4P27816 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP4P27816 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP4P27816 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP4P27816 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP4P27816 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP4P27816 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MAP4P27816 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP4P27816 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP4P27816 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP4P27816 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP4P27816 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP4P27816 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MAP4P27816 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP4P27816 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP4P27816 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP4P27816 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP4P27816 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP4P27816 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP4P27816 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP4P27816 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MAP4P27816 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP4P27816 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP4P27816 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MAP4P27816 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP4P27816 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP4P27816 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MAP4P27816 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms