Protein–RNA interactions for Protein: P24386

CHM, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 1, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMP24386 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP24386 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP24386 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CHMP24386 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP24386 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP24386 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP24386 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP24386 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP24386 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP24386 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CHMP24386 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CHMP24386 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CHMP24386 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP24386 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CHMP24386 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP24386 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP24386 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP24386 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP24386 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP24386 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CHMP24386 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP24386 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP24386 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CHMP24386 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CHMP24386 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CHMP24386 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CHMP24386 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CHMP24386 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP24386 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CHMP24386 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP24386 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CHMP24386 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms