Protein–RNA interactions for Protein: P23510

TNFSF4, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF4P23510 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TNFSF4P23510 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
TNFSF4P23510 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
TNFSF4P23510 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms