Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
NR4A1P22736 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NR4A1P22736 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NR4A1P22736 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms