Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ATP6V1B2P21281 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ATP6V1B2P21281 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms