Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
EFNA1P20827 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.64■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
EFNA1P20827 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
EFNA1P20827 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms