Protein–RNA interactions for Protein: P20807

CAPN3, Calpain-3, humanhuman

Predictions only

Length 821 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN3P20807 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN3P20807 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CAPN3P20807 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CAPN3P20807 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1124.7 ms