Protein–RNA interactions for Protein: P20020

ATP2B1, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B1P20020 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ATP2B1P20020 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
ATP2B1P20020 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
ATP2B1P20020 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATP2B1P20020 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.5 ms