Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR1P18146 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR1P18146 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR1P18146 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR1P18146 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR1P18146 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
EGR1P18146 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR1P18146 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR1P18146 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR1P18146 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
EGR1P18146 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR1P18146 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR1P18146 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR1P18146 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR1P18146 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR1P18146 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
EGR1P18146 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR1P18146 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR1P18146 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR1P18146 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR1P18146 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR1P18146 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR1P18146 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EGR1P18146 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EGR1P18146 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EGR1P18146 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR1P18146 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR1P18146 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EGR1P18146 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EGR1P18146 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR1P18146 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR1P18146 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR1P18146 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR1P18146 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR1P18146 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR1P18146 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EGR1P18146 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR1P18146 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR1P18146 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR1P18146 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR1P18146 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR1P18146 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EGR1P18146 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
EGR1P18146 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EGR1P18146 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR1P18146 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR1P18146 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR1P18146 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
EGR1P18146 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
EGR1P18146 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR1P18146 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR1P18146 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR1P18146 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
EGR1P18146 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.1 ms