Protein–RNA interactions for Protein: P16473

TSHR, Thyrotropin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSHRP16473 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSHRP16473 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TSHRP16473 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSHRP16473 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSHRP16473 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSHRP16473 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TSHRP16473 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSHRP16473 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSHRP16473 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSHRP16473 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TSHRP16473 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSHRP16473 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TSHRP16473 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSHRP16473 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
TSHRP16473 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TSHRP16473 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TSHRP16473 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TSHRP16473 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TSHRP16473 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSHRP16473 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSHRP16473 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TSHRP16473 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSHRP16473 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TSHRP16473 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSHRP16473 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TSHRP16473 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSHRP16473 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSHRP16473 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSHRP16473 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSHRP16473 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSHRP16473 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSHRP16473 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSHRP16473 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TSHRP16473 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TSHRP16473 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TSHRP16473 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TSHRP16473 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSHRP16473 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSHRP16473 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSHRP16473 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSHRP16473 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSHRP16473 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TSHRP16473 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms