Protein–RNA interactions for Protein: P15882

CHN1, N-chimaerin, humanhuman

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHN1P15882 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHN1P15882 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHN1P15882 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHN1P15882 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHN1P15882 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CHN1P15882 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHN1P15882 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHN1P15882 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHN1P15882 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHN1P15882 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CHN1P15882 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CHN1P15882 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHN1P15882 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHN1P15882 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
CHN1P15882 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHN1P15882 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHN1P15882 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHN1P15882 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CHN1P15882 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHN1P15882 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHN1P15882 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHN1P15882 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CHN1P15882 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
CHN1P15882 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHN1P15882 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHN1P15882 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
CHN1P15882 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHN1P15882 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
CHN1P15882 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
CHN1P15882 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHN1P15882 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHN1P15882 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHN1P15882 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHN1P15882 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
CHN1P15882 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHN1P15882 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHN1P15882 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHN1P15882 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHN1P15882 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHN1P15882 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHN1P15882 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
CHN1P15882 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHN1P15882 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHN1P15882 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
CHN1P15882 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
CHN1P15882 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHN1P15882 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHN1P15882 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHN1P15882 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHN1P15882 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHN1P15882 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
CHN1P15882 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHN1P15882 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHN1P15882 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
CHN1P15882 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CHN1P15882 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHN1P15882 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHN1P15882 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHN1P15882 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHN1P15882 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHN1P15882 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CHN1P15882 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHN1P15882 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHN1P15882 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHN1P15882 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHN1P15882 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHN1P15882 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CHN1P15882 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHN1P15882 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHN1P15882 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHN1P15882 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CHN1P15882 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CHN1P15882 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms