Protein–RNA interactions for Protein: P15172

MYOD1, Myoblast determination protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYOD1P15172 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MYOD1P15172 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
MYOD1P15172 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
MYOD1P15172 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 158 ms