Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC130P13994 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC130P13994 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CCDC130P13994 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC130P13994 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms