Protein–RNA interactions for Protein: P13569

CFTR, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, humanhuman

Predictions only

Length 1,480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFTRP13569 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC41.96■■■■■ 4.31
CFTRP13569 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.95■■■■■ 4.31
CFTRP13569 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC41.95■■■■■ 4.31
CFTRP13569 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.31
CFTRP13569 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.31
CFTRP13569 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CFTRP13569 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC41.94■■■■■ 4.3
CFTRP13569 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC41.93■■■■■ 4.3
CFTRP13569 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.92■■■■■ 4.3
CFTRP13569 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
CFTRP13569 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CFTRP13569 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CFTRP13569 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.91■■■■■ 4.3
CFTRP13569 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC41.91■■■■■ 4.3
CFTRP13569 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC41.91■■■■■ 4.3
CFTRP13569 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CFTRP13569 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
CFTRP13569 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
CFTRP13569 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
CFTRP13569 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC41.9■■■■■ 4.3
CFTRP13569 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CFTRP13569 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CFTRP13569 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CFTRP13569 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
CFTRP13569 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CFTRP13569 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.89■■■■■ 4.3
CFTRP13569 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC41.88■■■■■ 4.29
CFTRP13569 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CFTRP13569 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CFTRP13569 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC41.87■■■■■ 4.29
CFTRP13569 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.87■■■■■ 4.29
CFTRP13569 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CFTRP13569 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
CFTRP13569 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CFTRP13569 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC41.86■■■■■ 4.29
CFTRP13569 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC41.86■■■■■ 4.29
CFTRP13569 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
CFTRP13569 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC41.84■■■■■ 4.29
CFTRP13569 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
CFTRP13569 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
CFTRP13569 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CFTRP13569 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CFTRP13569 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CFTRP13569 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CFTRP13569 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC41.82■■■■■ 4.29
CFTRP13569 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.82■■■■■ 4.29
CFTRP13569 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CFTRP13569 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CFTRP13569 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC41.81■■■■■ 4.28
CFTRP13569 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC41.81■■■■■ 4.28
CFTRP13569 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC41.8■■■■■ 4.28
CFTRP13569 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CFTRP13569 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CFTRP13569 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
CFTRP13569 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CFTRP13569 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
CFTRP13569 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC41.77■■■■■ 4.28
CFTRP13569 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.28
CFTRP13569 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.76■■■■■ 4.27
CFTRP13569 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CFTRP13569 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC41.75■■■■■ 4.27
CFTRP13569 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.75■■■■■ 4.27
CFTRP13569 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CFTRP13569 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CFTRP13569 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CFTRP13569 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.74■■■■■ 4.27
CFTRP13569 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
CFTRP13569 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC41.73■■■■■ 4.27
CFTRP13569 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC41.73■■■■■ 4.27
CFTRP13569 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CFTRP13569 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
CFTRP13569 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.72■■■■■ 4.27
CFTRP13569 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CFTRP13569 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC41.72■■■■■ 4.27
CFTRP13569 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CFTRP13569 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CFTRP13569 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CFTRP13569 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CFTRP13569 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC41.72■■■■■ 4.27
CFTRP13569 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC41.71■■■■■ 4.27
CFTRP13569 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CFTRP13569 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC41.71■■■■■ 4.27
CFTRP13569 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CFTRP13569 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CFTRP13569 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CFTRP13569 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.7■■■■■ 4.27
CFTRP13569 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.7■■■■■ 4.27
CFTRP13569 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.69■■■■■ 4.26
CFTRP13569 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.68■■■■■ 4.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms