Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
BCKDHAP12694 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
BCKDHAP12694 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
BCKDHAP12694 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms