Protein–RNA interactions for Protein: P11172

UMPS, Uridine 5'-monophosphate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UMPSP11172 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UMPSP11172 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UMPSP11172 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UMPSP11172 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UMPSP11172 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UMPSP11172 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UMPSP11172 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UMPSP11172 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UMPSP11172 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UMPSP11172 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
UMPSP11172 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
UMPSP11172 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
UMPSP11172 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
UMPSP11172 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
UMPSP11172 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UMPSP11172 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UMPSP11172 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
UMPSP11172 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
UMPSP11172 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
UMPSP11172 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
UMPSP11172 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UMPSP11172 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
UMPSP11172 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UMPSP11172 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UMPSP11172 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
UMPSP11172 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
UMPSP11172 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UMPSP11172 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UMPSP11172 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
UMPSP11172 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UMPSP11172 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
UMPSP11172 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms