Protein–RNA interactions for Protein: P0C7W0

PRR29, Proline-rich protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR29P0C7W0 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PRR29P0C7W0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
PRR29P0C7W0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
PRR29P0C7W0 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PRR29P0C7W0 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms