Protein–RNA interactions for Protein: P08493

MGP, Matrix Gla protein, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MGPP08493 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGPP08493 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
MGPP08493 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
MGPP08493 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
MGPP08493 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
MGPP08493 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
MGPP08493 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
MGPP08493 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MGPP08493 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MGPP08493 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MGPP08493 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
MGPP08493 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
MGPP08493 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MGPP08493 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MGPP08493 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MGPP08493 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MGPP08493 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MGPP08493 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MGPP08493 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms