Protein–RNA interactions for Protein: P07900

HSP90AA1, Heat shock protein HSP 90-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AA1P07900 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
HSP90AA1P07900 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
HSP90AA1P07900 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HSP90AA1P07900 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA1P07900 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA1P07900 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA1P07900 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA1P07900 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA1P07900 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
HSP90AA1P07900 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms