Protein–RNA interactions for Protein: P07358

C8B, Complement component C8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C8BP07358 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
C8BP07358 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8BP07358 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8BP07358 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
C8BP07358 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8BP07358 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8BP07358 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8BP07358 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8BP07358 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
C8BP07358 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
C8BP07358 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8BP07358 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8BP07358 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8BP07358 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8BP07358 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8BP07358 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8BP07358 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8BP07358 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
C8BP07358 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8BP07358 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8BP07358 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8BP07358 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
C8BP07358 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8BP07358 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8BP07358 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8BP07358 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8BP07358 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
C8BP07358 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8BP07358 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8BP07358 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8BP07358 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C8BP07358 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8BP07358 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
C8BP07358 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
C8BP07358 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
C8BP07358 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8BP07358 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8BP07358 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8BP07358 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8BP07358 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8BP07358 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
C8BP07358 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8BP07358 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8BP07358 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8BP07358 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8BP07358 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8BP07358 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8BP07358 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
C8BP07358 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
C8BP07358 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8BP07358 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
C8BP07358 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8BP07358 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8BP07358 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8BP07358 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8BP07358 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8BP07358 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
C8BP07358 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8BP07358 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8BP07358 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8BP07358 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
C8BP07358 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8BP07358 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8BP07358 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8BP07358 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8BP07358 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8BP07358 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
C8BP07358 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.1 ms