Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
NEFLP07196 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEFLP07196 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEFLP07196 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEFLP07196 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
NEFLP07196 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.41■■■□□ 2.62
NEFLP07196 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEFLP07196 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEFLP07196 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEFLP07196 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
NEFLP07196 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEFLP07196 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
NEFLP07196 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEFLP07196 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEFLP07196 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
NEFLP07196 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEFLP07196 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
NEFLP07196 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEFLP07196 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
NEFLP07196 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEFLP07196 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEFLP07196 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEFLP07196 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEFLP07196 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
NEFLP07196 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
NEFLP07196 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEFLP07196 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEFLP07196 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEFLP07196 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEFLP07196 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
NEFLP07196 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
NEFLP07196 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.61
NEFLP07196 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEFLP07196 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEFLP07196 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
NEFLP07196 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEFLP07196 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEFLP07196 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEFLP07196 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEFLP07196 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEFLP07196 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEFLP07196 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
NEFLP07196 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEFLP07196 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEFLP07196 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEFLP07196 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEFLP07196 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
NEFLP07196 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEFLP07196 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEFLP07196 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
NEFLP07196 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
NEFLP07196 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEFLP07196 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEFLP07196 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEFLP07196 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC31.27■■■□□ 2.6
NEFLP07196 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEFLP07196 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEFLP07196 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEFLP07196 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
NEFLP07196 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEFLP07196 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEFLP07196 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEFLP07196 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEFLP07196 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEFLP07196 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
NEFLP07196 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEFLP07196 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEFLP07196 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEFLP07196 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC31.25■■■□□ 2.59
NEFLP07196 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEFLP07196 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEFLP07196 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEFLP07196 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEFLP07196 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEFLP07196 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEFLP07196 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC31.24■■■□□ 2.59
NEFLP07196 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEFLP07196 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEFLP07196 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEFLP07196 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEFLP07196 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEFLP07196 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
NEFLP07196 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEFLP07196 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEFLP07196 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEFLP07196 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEFLP07196 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.22■■■□□ 2.59
NEFLP07196 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEFLP07196 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEFLP07196 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC31.21■■■□□ 2.59
NEFLP07196 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
NEFLP07196 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 390 ms