Protein–RNA interactions for Protein: P06746

POLB, DNA polymerase beta, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLBP06746 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLBP06746 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLBP06746 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLBP06746 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLBP06746 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
POLBP06746 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
POLBP06746 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
POLBP06746 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLBP06746 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLBP06746 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLBP06746 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
POLBP06746 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLBP06746 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
POLBP06746 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLBP06746 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLBP06746 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLBP06746 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLBP06746 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLBP06746 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
POLBP06746 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLBP06746 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLBP06746 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLBP06746 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLBP06746 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLBP06746 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLBP06746 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
POLBP06746 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
POLBP06746 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLBP06746 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLBP06746 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLBP06746 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLBP06746 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLBP06746 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLBP06746 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
POLBP06746 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLBP06746 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
POLBP06746 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLBP06746 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLBP06746 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLBP06746 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
POLBP06746 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLBP06746 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLBP06746 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLBP06746 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLBP06746 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLBP06746 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
POLBP06746 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLBP06746 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
POLBP06746 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLBP06746 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLBP06746 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLBP06746 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
POLBP06746 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLBP06746 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLBP06746 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLBP06746 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLBP06746 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLBP06746 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
POLBP06746 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
POLBP06746 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLBP06746 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLBP06746 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLBP06746 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
POLBP06746 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLBP06746 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLBP06746 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLBP06746 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLBP06746 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLBP06746 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLBP06746 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
POLBP06746 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
POLBP06746 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLBP06746 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLBP06746 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLBP06746 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLBP06746 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLBP06746 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLBP06746 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
POLBP06746 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLBP06746 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLBP06746 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
POLBP06746 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
POLBP06746 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
POLBP06746 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLBP06746 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLBP06746 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLBP06746 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
POLBP06746 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24■■□□□ 1.43
POLBP06746 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
POLBP06746 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms