Protein–RNA interactions for Protein: P04818

TYMS, Thymidylate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TYMSP04818 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
TYMSP04818 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
TYMSP04818 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYMSP04818 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
TYMSP04818 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
TYMSP04818 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYMSP04818 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYMSP04818 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYMSP04818 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
TYMSP04818 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
TYMSP04818 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYMSP04818 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYMSP04818 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYMSP04818 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYMSP04818 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYMSP04818 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TYMSP04818 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TYMSP04818 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.5
TYMSP04818 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TYMSP04818 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TYMSP04818 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYMSP04818 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYMSP04818 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TYMSP04818 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms