Protein–RNA interactions for Protein: P04279

SEMG1, Semenogelin-1, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMG1P04279 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SEMG1P04279 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SEMG1P04279 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SEMG1P04279 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms