Protein–RNA interactions for Protein: P00533

EGFR, Epidermal growth factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGFRP00533 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
EGFRP00533 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EGFRP00533 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
EGFRP00533 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.21
EGFRP00533 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFRP00533 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFRP00533 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFRP00533 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFRP00533 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFRP00533 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFRP00533 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFRP00533 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
EGFRP00533 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EGFRP00533 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
EGFRP00533 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EGFRP00533 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EGFRP00533 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EGFRP00533 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
EGFRP00533 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
EGFRP00533 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EGFRP00533 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EGFRP00533 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
EGFRP00533 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
EGFRP00533 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFRP00533 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFRP00533 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFRP00533 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFRP00533 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFRP00533 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
EGFRP00533 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
EGFRP00533 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EGFRP00533 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
EGFRP00533 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EGFRP00533 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
EGFRP00533 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
EGFRP00533 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EGFRP00533 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
EGFRP00533 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
EGFRP00533 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
EGFRP00533 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EGFRP00533 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EGFRP00533 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EGFRP00533 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
EGFRP00533 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EGFRP00533 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EGFRP00533 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
EGFRP00533 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EGFRP00533 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
EGFRP00533 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EGFRP00533 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
EGFRP00533 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EGFRP00533 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EGFRP00533 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EGFRP00533 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EGFRP00533 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
EGFRP00533 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
EGFRP00533 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
EGFRP00533 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EGFRP00533 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EGFRP00533 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
EGFRP00533 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EGFRP00533 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EGFRP00533 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EGFRP00533 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
EGFRP00533 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EGFRP00533 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EGFRP00533 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EGFRP00533 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
EGFRP00533 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
EGFRP00533 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
EGFRP00533 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EGFRP00533 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EGFRP00533 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EGFRP00533 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EGFRP00533 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EGFRP00533 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
EGFRP00533 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
EGFRP00533 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
EGFRP00533 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EGFRP00533 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
EGFRP00533 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
EGFRP00533 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
EGFRP00533 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms