Protein–RNA interactions for Protein: O95983

MBD3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD3O95983 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD3O95983 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD3O95983 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
MBD3O95983 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
MBD3O95983 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD3O95983 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD3O95983 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
MBD3O95983 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MBD3O95983 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
MBD3O95983 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD3O95983 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD3O95983 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD3O95983 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
MBD3O95983 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD3O95983 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD3O95983 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD3O95983 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD3O95983 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
MBD3O95983 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD3O95983 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD3O95983 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD3O95983 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD3O95983 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD3O95983 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
MBD3O95983 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD3O95983 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD3O95983 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD3O95983 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD3O95983 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD3O95983 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD3O95983 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD3O95983 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
MBD3O95983 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD3O95983 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD3O95983 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD3O95983 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
MBD3O95983 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD3O95983 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD3O95983 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD3O95983 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
MBD3O95983 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
MBD3O95983 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD3O95983 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD3O95983 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD3O95983 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
MBD3O95983 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD3O95983 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD3O95983 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
MBD3O95983 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
MBD3O95983 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD3O95983 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD3O95983 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD3O95983 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD3O95983 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD3O95983 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD3O95983 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD3O95983 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
MBD3O95983 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD3O95983 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD3O95983 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD3O95983 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD3O95983 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD3O95983 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD3O95983 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
MBD3O95983 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
MBD3O95983 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD3O95983 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD3O95983 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD3O95983 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
MBD3O95983 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
MBD3O95983 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms