Protein–RNA interactions for Protein: O95486

SEC24A, Protein transport protein Sec24A, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24AO95486 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SEC24AO95486 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SEC24AO95486 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SEC24AO95486 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SEC24AO95486 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.6 ms