Protein–RNA interactions for Protein: O95473

SYNGR4, Synaptogyrin-4, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR4O95473 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SYNGR4O95473 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
SYNGR4O95473 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
SYNGR4O95473 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR4O95473 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR4O95473 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR4O95473 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR4O95473 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR4O95473 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
SYNGR4O95473 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
SYNGR4O95473 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR4O95473 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR4O95473 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR4O95473 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR4O95473 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
SYNGR4O95473 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms