Protein–RNA interactions for Protein: O95259

KCNH1, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 1, humanhuman

Predictions only

Length 989 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH1O95259 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
KCNH1O95259 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
KCNH1O95259 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
KCNH1O95259 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms