Protein–RNA interactions for Protein: O95149

SNUPN, Snurportin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNUPNO95149 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SNUPNO95149 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SNUPNO95149 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SNUPNO95149 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.9 ms