Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SKAP2O75563 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SKAP2O75563 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SKAP2O75563 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms