Protein–RNA interactions for Protein: O75531

BANF1, Barrier-to-autointegration factor, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BANF1O75531 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BANF1O75531 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
BANF1O75531 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BANF1O75531 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
BANF1O75531 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BANF1O75531 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
BANF1O75531 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
BANF1O75531 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
BANF1O75531 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
BANF1O75531 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BANF1O75531 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
BANF1O75531 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
BANF1O75531 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BANF1O75531 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BANF1O75531 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BANF1O75531 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
BANF1O75531 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
BANF1O75531 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
BANF1O75531 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BANF1O75531 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BANF1O75531 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BANF1O75531 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
BANF1O75531 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
BANF1O75531 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BANF1O75531 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BANF1O75531 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BANF1O75531 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
BANF1O75531 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BANF1O75531 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
BANF1O75531 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
BANF1O75531 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BANF1O75531 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
BANF1O75531 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
BANF1O75531 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BANF1O75531 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
BANF1O75531 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
BANF1O75531 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BANF1O75531 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BANF1O75531 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BANF1O75531 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BANF1O75531 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
BANF1O75531 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
BANF1O75531 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms