Protein–RNA interactions for Protein: O75487

GPC4, Glypican-4, humanhuman

Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC4O75487 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
GPC4O75487 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC4O75487 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC4O75487 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC4O75487 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC4O75487 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC4O75487 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC4O75487 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
GPC4O75487 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC4O75487 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC4O75487 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC4O75487 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC4O75487 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC4O75487 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC4O75487 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC4O75487 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
GPC4O75487 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC4O75487 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC4O75487 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
GPC4O75487 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
GPC4O75487 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC4O75487 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC4O75487 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC4O75487 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC4O75487 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC4O75487 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
GPC4O75487 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
GPC4O75487 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC4O75487 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC4O75487 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
GPC4O75487 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GPC4O75487 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC4O75487 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC4O75487 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC4O75487 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GPC4O75487 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC4O75487 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC4O75487 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC4O75487 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC4O75487 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC4O75487 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC4O75487 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC4O75487 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GPC4O75487 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC4O75487 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC4O75487 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC4O75487 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC4O75487 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC4O75487 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC4O75487 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GPC4O75487 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC4O75487 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC4O75487 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC4O75487 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC4O75487 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC4O75487 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GPC4O75487 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC4O75487 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC4O75487 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GPC4O75487 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC4O75487 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC4O75487 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC4O75487 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC4O75487 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GPC4O75487 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC4O75487 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC4O75487 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC4O75487 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC4O75487 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GPC4O75487 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC4O75487 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC4O75487 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC4O75487 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GPC4O75487 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC4O75487 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC4O75487 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC4O75487 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GPC4O75487 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms