Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
E2F6O75461 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
E2F6O75461 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F6O75461 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F6O75461 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F6O75461 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F6O75461 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F6O75461 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F6O75461 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F6O75461 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
E2F6O75461 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
E2F6O75461 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F6O75461 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F6O75461 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F6O75461 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F6O75461 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
E2F6O75461 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F6O75461 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F6O75461 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F6O75461 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F6O75461 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
E2F6O75461 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
E2F6O75461 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
E2F6O75461 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
E2F6O75461 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
E2F6O75461 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F6O75461 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F6O75461 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
E2F6O75461 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F6O75461 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F6O75461 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F6O75461 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F6O75461 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F6O75461 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
E2F6O75461 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F6O75461 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F6O75461 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F6O75461 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
E2F6O75461 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
E2F6O75461 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms