Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SRGAP2O75044 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SRGAP2O75044 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SRGAP2O75044 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SRGAP2O75044 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms