Protein–RNA interactions for Protein: O60888

CUTA, Protein CutA, humanhuman

Predictions only

Length 179 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUTAO60888 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUTAO60888 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUTAO60888 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUTAO60888 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUTAO60888 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUTAO60888 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CUTAO60888 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUTAO60888 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUTAO60888 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUTAO60888 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUTAO60888 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CUTAO60888 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUTAO60888 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUTAO60888 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CUTAO60888 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUTAO60888 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
CUTAO60888 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CUTAO60888 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUTAO60888 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUTAO60888 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
CUTAO60888 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUTAO60888 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUTAO60888 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CUTAO60888 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUTAO60888 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUTAO60888 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUTAO60888 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CUTAO60888 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CUTAO60888 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUTAO60888 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUTAO60888 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUTAO60888 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUTAO60888 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUTAO60888 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CUTAO60888 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUTAO60888 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUTAO60888 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
CUTAO60888 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CUTAO60888 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUTAO60888 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CUTAO60888 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUTAO60888 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUTAO60888 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUTAO60888 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CUTAO60888 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUTAO60888 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUTAO60888 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUTAO60888 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CUTAO60888 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CUTAO60888 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUTAO60888 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUTAO60888 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUTAO60888 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUTAO60888 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUTAO60888 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUTAO60888 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CUTAO60888 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CUTAO60888 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUTAO60888 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUTAO60888 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUTAO60888 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUTAO60888 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUTAO60888 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CUTAO60888 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUTAO60888 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUTAO60888 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
CUTAO60888 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUTAO60888 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUTAO60888 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUTAO60888 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CUTAO60888 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CUTAO60888 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUTAO60888 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUTAO60888 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUTAO60888 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUTAO60888 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUTAO60888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUTAO60888 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
CUTAO60888 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUTAO60888 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CUTAO60888 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms