Protein–RNA interactions for Protein: O43889

CREB3, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CREB3O43889 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CREB3O43889 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CREB3O43889 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3O43889 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3O43889 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CREB3O43889 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3O43889 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3O43889 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3O43889 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3O43889 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3O43889 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CREB3O43889 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CREB3O43889 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3O43889 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3O43889 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3O43889 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3O43889 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3O43889 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CREB3O43889 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3O43889 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3O43889 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3O43889 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3O43889 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3O43889 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3O43889 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CREB3O43889 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3O43889 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3O43889 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3O43889 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3O43889 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3O43889 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CREB3O43889 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CREB3O43889 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3O43889 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3O43889 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3O43889 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3O43889 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3O43889 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3O43889 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CREB3O43889 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB3O43889 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
CREB3O43889 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3O43889 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3O43889 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3O43889 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3O43889 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3O43889 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3O43889 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3O43889 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CREB3O43889 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3O43889 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3O43889 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3O43889 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3O43889 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3O43889 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CREB3O43889 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3O43889 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3O43889 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3O43889 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3O43889 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3O43889 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3O43889 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CREB3O43889 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3O43889 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3O43889 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3O43889 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3O43889 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3O43889 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3O43889 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CREB3O43889 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms