Protein–RNA interactions for Protein: O43818

RRP9, U3 small nucleolar RNA-interacting protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP9O43818 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP9O43818 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP9O43818 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP9O43818 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP9O43818 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP9O43818 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
RRP9O43818 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP9O43818 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP9O43818 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP9O43818 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP9O43818 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP9O43818 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP9O43818 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
RRP9O43818 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
RRP9O43818 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP9O43818 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP9O43818 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
RRP9O43818 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP9O43818 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP9O43818 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP9O43818 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP9O43818 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
RRP9O43818 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
RRP9O43818 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP9O43818 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP9O43818 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP9O43818 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP9O43818 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP9O43818 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP9O43818 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP9O43818 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
RRP9O43818 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP9O43818 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP9O43818 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP9O43818 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP9O43818 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
RRP9O43818 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP9O43818 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP9O43818 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP9O43818 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP9O43818 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP9O43818 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RRP9O43818 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP9O43818 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP9O43818 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP9O43818 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RRP9O43818 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RRP9O43818 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.68
RRP9O43818 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP9O43818 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP9O43818 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP9O43818 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP9O43818 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RRP9O43818 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP9O43818 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP9O43818 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP9O43818 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP9O43818 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP9O43818 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP9O43818 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RRP9O43818 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP9O43818 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP9O43818 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP9O43818 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP9O43818 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP9O43818 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP9O43818 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP9O43818 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RRP9O43818 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP9O43818 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RRP9O43818 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RRP9O43818 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP9O43818 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP9O43818 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP9O43818 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP9O43818 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP9O43818 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RRP9O43818 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP9O43818 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP9O43818 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RRP9O43818 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.6 ms