Protein–RNA interactions for Protein: O43493

TGOLN2, Trans-Golgi network integral membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGOLN2O43493 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
TGOLN2O43493 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
TGOLN2O43493 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
TGOLN2O43493 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms