Protein–RNA interactions for Protein: O43278

SPINT1, Kunitz-type protease inhibitor 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT1O43278 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SPINT1O43278 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SPINT1O43278 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SPINT1O43278 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.5 ms