Protein–RNA interactions for Protein: O43272

PRODH, Proline dehydrogenase 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 600 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRODHO43272 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PRODHO43272 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
PRODHO43272 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRODHO43272 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRODHO43272 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PRODHO43272 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PRODHO43272 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PRODHO43272 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRODHO43272 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRODHO43272 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRODHO43272 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PRODHO43272 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
PRODHO43272 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PRODHO43272 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRODHO43272 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRODHO43272 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRODHO43272 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRODHO43272 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PRODHO43272 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRODHO43272 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRODHO43272 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRODHO43272 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRODHO43272 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRODHO43272 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PRODHO43272 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PRODHO43272 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PRODHO43272 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRODHO43272 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRODHO43272 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PRODHO43272 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRODHO43272 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PRODHO43272 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRODHO43272 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRODHO43272 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRODHO43272 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PRODHO43272 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRODHO43272 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRODHO43272 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PRODHO43272 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRODHO43272 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PRODHO43272 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.3 ms